随着科技的发展，分子成像技术出现，使活体动物脑成像成为可能。动物活体脑成像就是应用影像学的技术方法，对动物的脑活动状态进行的组织、细胞和分子水平的定性和定量的研究。现今主要的动物脑成像技术主要有以下几种：

1. 光学成像Optical imaging

这种成像方式是通过较为灵敏的光学元件及CCD，将光的信号转变为电的信号，然后转换成图像输出。活体动物的成像分为荧光成像和生物发光成像两种。目前，光学成像是科研中应用广泛的成像技术之一，这种方法的灵敏度较高而且操作也较为简单。

2. 正电子发射断层扫描 PET

这种成像方式是通过在生物生命代谢的必须物质上标记着寿命较短的放射性核素，将这种核素注入体内之后，观察该物质在生物体中的聚集情况，来表现生物体的代谢活动，进而对动物的脑部或其他部位的状态进行诊断，但这种方法的使用成本较高。

3. 单光子发射计算机断层扫描SPECT

这种方法通过利用放射性同位素来标记化合物，放射性同位素可以发出一个或者多个射线并具有相应特征的能量。在研究过程中，能够对三维空间中的放射性示踪剂进行准确的定位，这种方式比较适合动物脑成像和功能性心脏的成像。

4. 磁共振成像MRI

这种方式是将某种特定频率的射频脉冲施加在磁场的活体中，从而因活体中的氢质子受到了刺激而发生磁共振。在脉冲刺激停止后，质子在变得松弛的过程中会释放微弱的能量。利用接收信号、空间编码和重建图像等，创造出MRI图像，这种成像方式在有关运动伤害的诊断上较为常见。